臺灣在水產科技產業具有強大潛能與優勢，在新品種開發、種苗培育、繁殖與生產、養殖管理技術、飼料生產及行銷系統等策略，皆已發展完整之水產養殖產業技術，在國際市場上占重要一席之地。臺灣水產養殖興盛，於養殖科技方面，一直維持高度的競爭優勢，石斑魚及金目鱸皆會遭受神經壞死病毒及虹彩病毒之攻擊。有關會遭受感染神經壞死病毒 之魚類全球超過120多種，而虹彩病毒會感染超過 40 種以上之魚種，侵害甚鉅。本項技術包括已開發可專一性抑制 NNV 與 GIV之殼蛋白表現小片段干擾RNA核酸分子，另一技術則為核酸包覆系統，係透過脂質體將核酸包覆，核酸透過脂質體保護，可順利抵達魚隻的尾腸，提高有效性，且施用便利，為破壞性創新技術。
近年來，雄性蝦苗在水產養殖產業中已備受矚目，為一項受關注的創新技術。這一方法不僅提升了泰國蝦養殖業的生產效益，也為持續性水產養殖提供了新的前景。偽雌性種蝦是指在養殖過程中使用生物科技方法促使泰國蝦改變表徵，其性別為雄性，此技術通過第一階段種苗的生產進而挑選出健康且品質高的。一般而言，泰國蝦通常的雄性比例為35%，雄性泰國蝦受到養殖業者的喜愛，因為它們生長更快，並且具有更高的價值，因此建立偽雌性種蝦進而產下多雄性蝦苗，能夠使泰國蝦產業更有效地提高產量，減少競爭和環境影響。種蝦篩選是水產養殖過程中的關鍵步驟，以確保健康、優質的種蝦生產健康優質的種苗。